正磷酸是由一个单一的磷氧四面体构成的磷酸。在磷酸分子中P原子是sp杂化的，3个杂化轨道与氧原子间形成3个σ键，另一个P—O键是由一个从磷到氧的σ配键和两个由氧到磷的d-pπ键组成的。σ配键是磷原子上的一对孤对电子向氧原子的空轨道配位而形成。d←p配键是氧原子的py、pz轨道上的两对孤对电子和磷原子的dxz、dyz空轨道重叠而成。由于磷原子3d能级比氧原子的2p能级能量高很多，组成的分子轨道不是很有效的，所以P—O键从数目上来看是三重键，但从键能和键长来看是介于单键和双键之间。这可能是磷酸浓溶液之所以粘稠的原因。
磷酸结晶就像其他液体结晶一样属于物理变化而非化学变化。其化学性质不会因结晶而改变，也即磷酸的质量是不会因结晶而受影响的，只要给予温度熔化或加热水稀释溶化，仍可以正常使用。结晶特性：磷酸浓度高、纯度高，结晶性高。据经验，当气温在4摄氏度上下，浓度大于85%时，其结晶性增大，若不慎混入结（冰）晶磷酸，会造成原本没有结（冰）晶的磷酸立即而结（冰）晶，而且磷酸结（冰）晶异常迅速，直致磷酸储存容器大部结（冰）晶。磷酸结（冰）晶后，上部磷酸边稀，下部沉积针状结（冰）晶体纯磷酸。
1农业：种植田作物需要的磷肥就是以磷酸为原材料生产的，磷肥里面包含过磷酸钙、磷酸二氢钾等物质，生产饲料所需的营养剂磷酸二氢钙也是以磷酸为原材料配置而成。2工业：磷酸在化工领域也占据一定的地位，属于一种化工原料。工业磷酸可以清理金属表面一些难溶的磷酸盐薄膜，可以避免金属遭到腐蚀，起保护作用；工业磷酸与酸混合后可以制成化学抛光剂，可以提高金属性能；工业磷酸还可用作虫剂的原料磷酸以及洗涤用品；工业磷酸可以作为生产含磷阻燃剂的原料。3医学：含磷可以通过磷酸制取，甘油磷酸钠就是由磷酸配置而成。4食品：磷酸可以作为食品添加剂，除此之外还可用作营养增强剂，包括酵母营养剂、酸味剂等。
磷酸的主要作用：1、磷酸是生产重要的磷肥(过磷酸钙、磷酸二氢钾等)的原料，也是生产饲料营养剂(磷酸二氢钙)的原料。2、处理金属表面，在金属表面生成难溶的磷酸盐薄膜，以保护金属免受腐蚀。3、和酸混合作为化学抛光剂，用以提高金属表面的光洁度。4、生产洗涤用品、虫剂的原料磷酸。5、生产含磷阻燃剂的原料。6、磷酸是食品添加剂之一，在食品中作为酸味剂、酵母营养剂，可乐中就含有磷酸。磷酸盐也是重要的食品添加剂，可作为营养增强剂。7、磷酸可用于制取含磷，例如甘油磷酸钠等。